Stage de Master 2 dans l'équipe QCPS.

Etude des systèmes de sauvetage du ribosome chez Pseudomonas aeruginosa

Projet de Recherche de Master 2 – 2023

Encadrant : Christine Baysse

Notre équipe QCPS (IGDR, UMR6290 CNRS) est spécialisée dans l’étude de la trans-traduction, le mécanisme permettant de sauver les ribosomes bloqués et impliquant un ARNtm et une protéine associée, SmpB. Ce processus est une cible d’intérêt pour des stratégies antibactériennes puisqu’il est important pour la viabilité, l’antibio-tolérance et/ou la virulence des bactéries, et est absent chez les eucaryotes. Nous développons déjà des systèmes de criblages de molécules ciblant la trans-traduction chez E. coli et certains pathogènes. L’objectif de ce projet est d’étendre la spécificité des systèmes de criblage. Les infections à Pseudomonas aeruginosa chez les patients atteints de mucoviscidose restent à ce jour problématiques pour leur survie, malgré de nouvelles approches thérapeutiques. Il est primordial de découvrir des molécules dirigées contre de nouvelles cibles cellulaires, notamment pour minimiser la résistance croisée avec les antibiotiques existants. Notre objectif est de créer des systèmes de criblage à haut débit in vitro et in vivo spécifiquement dédiés à P. aeruginosa, en prenant en compte les contraintes liées à cette espèce. La stagiaire de Master 2 participera à la création du système de criblage in vitro en collaboration avec un doctorant, Mr Bastien L’Hermitte. De plus, l’importance des systèmes de déblocage des ribosomes sur la résistance et tolérance aux antibiotiques, la résistance aux stress et la persistance de P.  aeruginosa sera étudié par la création de mutants et leur analyse en différentes conditions de culture.  Ce projet est soutenu financièrement par l’association Vaincre la Mucoviscidose.

Pour postuler, merci d’envoyer une lettre de motivation et un CV à christine [dot] baysseatuniv-rennes1 [dot] fr

Tel. 0223236853

Institut de Génétique et de Développement de Rennes (IGDR), UMR6290 CNRS, Equipe QCPS263 avenue du Général Leclerc, CS 74205Campus de Beaulieu, Université de Rennes I, Bâtiment 1335042 RENNES CEDEX

 

Date de début : Janvier 2023
Durée : 6 mois.

 

Study of ribosome rescue systems in Pseudomonas aeruginosa

Master 2 Research Project - 2023

Supervisors: Christine Baysse

Our team (QCPS, IGDR, UMR6290 CNRS) is specialized in the study of trans-translation, the mechanism allowing the rescue of blocked ribosomes and involving a tmRNA and an associated protein, SmpB. This process is a target of interest for antibacterial strategies since it is important for viability, antibiotic tolerance and/or virulence of bacteria, and is absent in eukaryotes. We are already developing screening systems for molecules targeting trans-translation in Escherichia coli and some pathogens. The objective of this project is to extend the specificity of the screening systems to Pseudomonas aeruginosa. P. aeruginosainfections in cystic fibrosis patients are still problematic for their survival, despite new therapeutic approaches. It is essential to discover molecules directed against new cellular targets, especially to minimize cross-resistance with existing antibiotics. Our objective is to create high throughput in vitro and in vivo screening systems specifically dedicated to P. aeruginosa, considering the constraints related to this species. The Master 2 trainee will participate in the creation of the in vitro screening system in collaboration with a PhD student, Mr Bastien L'hermitte. In addition, the importance of systems to rescue ribosomes on antibiotic resistance and tolerance, stress resistance and persistence of P. aeruginosa will be studied by creating mutants and analyzing their fitness in different culture conditions.  This project is financially supported by the association “Vaincre la Mucoviscidose”.

To apply, please send a cover letter and a CV to christine [dot] baysseatuniv-rennes1 [dot] fr

Tel. +(22) 223236853

Institut de Génétique et de Développement de Rennes (IGDR), UMR6290 CNRS, Equipe QCPS263 avenue du Général Leclerc, CS 74205Campus de Beaulieu, Université de Rennes I, Bâtiment 1335042 RENNES CEDEX

 

Start date : January 2023
Duration : 6 months